目前，醫院醫療污水處理設備工藝按處理流程可分為一級處理、二級處理和三級處理，每一階段有不同的處理單元和工藝。

       根據醫院經營規模、特點和醫院類型，不同的醫院需要選擇不同的污水處理設備和工藝。如按醫院門診分類，可分為傳染病醫院和綜合性醫院。醫院門診的工業廢水方位分為水質和污水處理站兩類。醫院門診污水處理工藝要保證出水合格，一般要注意處理過程中的三個關鍵工藝：提升一級處理工藝、二級處理工藝和簡單的生化方案。傳染性疾病醫院一定要采取二級處理，一定要用二氧化氯發生器對污水進行消毒殺菌處理。對于污水排放到自然水體的醫院門診，必須選擇二級處理。建議將出水量排入大城市下水管道的綜合性醫院進行二級處理，而且必須提高一級工藝處理的實際效果。

       對于落后地區的中小型綜合醫院，當污水處理設備工藝標準不夠完善時，可以選擇簡單的生化處理作為過渡方案，然后逐步推進二次處理或一級處理強化工藝。